BAÜ, Bandırma İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi yedi bölümden oluşmaktadır. Bu bölümlerden İktisat, İşletme ve Maliye bölümlerinde I. ve II. Eğitim yapılırken, Kamu Yönetimi Bölümünde I. Eğitim yapılmaktadır. Lisans eğitimi, İngilizce Hazırlık Eğitimi dahil, beş yıldır. Fakültemizin tüm bölümlerinde kredili sistemle eğitim yapılmaktadır.
İktisat, İşletme, Maliye ve Kamu Yönetimi mezunları için Yüksek Lisans Programları vardır. Yüksek Lisans iki yıl olup Balıkesir Üniversitesi, Sosyal Bilimler Enstitüsünün organizasyonu altında yapılmaktadır. Ayrıca İşletme Bölümünde Tezsiz Yüksek Lisans, İktisat Bölümünde doktora programları mevcuttur.
